Nous ne pouvons pas nous écarter trop de la logique générale : le but de la généalogie, c'est de savoir quel devis a généré quelle facture, et dans le cas d'une génération automatique cette information n'a pas d'intérêt (vous pouvez la mettre dans les commentaires de la pièce d'origine, si vous voulez), d'autant que vous dites vous même que vous voudriez la modifier !
Dans votre exemple, vous avez un BL 3057 qui génère une facture client 4760, qui elle même génère une palanquée de factures. C'est quoi, ce cas d'usage ???
Que vous "tordiez" un peu les concepts de Gestan pour l'adapter à vos usages, c'est tout à fait normal, mais cela ne légitime pas que nous tordions le concept de notre côté : si on pouvait modifier complètement ce qu'on veut dans les liens de généalogie, il ne s'agirait pas d'une généalogie, mais de liens sans signification autre que conventionnelle.