Gestan gérant la comptabilité de très nombreuses entreprises (ou plus exactement la précompta, dans la mesure où il ne génère ni bilan ni liasse fiscale), sa capacité à gérer une compta ne fait pas débat.
Dans l'ordre des certitudes, les liaisons comptables ne disparaissent pas à chaque mise à jour et les résultat ne sont pas tantôt exacts, tantôt inexacts : il est plus probable que vous avez fait des modifications qui ont pu impacter les résultats, mais votre message ne comportant pas de descriptif précis, il est difficile de vous aider à distance. Dans votre cas, il faut "mettre les mains dans le cambouis".
En matière de comptabilité, le support peut vous répondre précisément sur les anomalies simples, par exemple, déclarer une vente qui serait déclarée sur un compte 6. Mais il ne peut pas vous renseigner sur le traitement des factures d'immo, par exemple, car ce n'est pas son métier. Pour des questions pointues sur la compta, nous proposons un support technique spécialisé, avec un comptable professionnel : je ne suis pas loin de penser que cela pourrait être pour vous une solution optimale, voir https://www.gestan.fr/assistance-comptable-specialisee/